采用支持介质的电泳应用广泛。采用支持介质的目的是防止电泳过程中的对流和扩散，使被分离组分得到最大分辨率的分离。

（１）无阻滞支持物　化学惰性，能将对流减到最小，其对蛋白质的分离是基于一定ｐＨ 条件下蛋白质的电荷密度。介质包括滤纸、醋酸纤维薄膜、纤维素、硅胶等。近年来其使用渐少。

（２）高密度凝胶　不仅能防止对流，降低样品扩散，还可以起到分子筛的作用，其对蛋白质的分离不仅取决于大分子的电荷密度，还取决于分子尺寸和形状。介质包括淀粉凝胶（由于质量不稳定且分离效果不好，已很少使用）、聚丙烯酰胺凝胶（孔径大小与蛋白质分子同数量级，因此具有分子筛作用）和琼脂糖凝胶（孔径较大，对大多数蛋白质仅有很小的分子筛作用）。

 

聚丙烯酰胺凝胶（ｐｏｌｙａｃｒｙｌａｍｉｄｅｇｅｌ）是由单体丙烯酰胺（ａｃｒｙｌａｍｉｄｅ，Ａｃｒ）和交联剂Ｎ，Ｎ′亚甲基双丙烯酰胺（Ｎ，Ｎ′ｍｅｔｈｙｌｅｎｅｂｉｓａｃｒｙｌａｍｉｄｅ，Ｂｉｓ）在增速剂和催化剂的作用下聚合而成的三维网状结构的凝胶。聚丙烯酰胺凝胶是目前最常用的电泳支持介质，它不仅可用于常规ＰＡＧＥ，也可用作ＳＤＳ-ＰＡＧＥ的凝胶介质，或用作等电聚焦等的介质。

聚丙烯酰胺凝胶的优点　
（1）在一定浓度时，凝胶透明，有弹性，机械性能好；
（2）化学性能稳定，与被分离物不起化学反应；
（3）对ｐＨ 和温度变化较稳定；
（4）几乎无电渗作用，样品分离重复性好；
（5）样品不易扩散，且用量少，其灵敏度可达１０－６ｇ；
（6）凝胶孔径可调节；分辨率高。
 

琼脂糖凝胶：天然琼脂由琼脂糖和琼脂胶组成，琼脂糖是由半乳糖及其衍生物构成的中性物质，不带电荷；而琼脂胶是一种含羧基和硫酸根的酸性多糖。琼脂糖也是电泳最常用的一种支持介质。一般常用１％琼脂糖作为电泳支持物。琼脂糖凝胶应用于ＤＮＡ分离、免疫电泳、蛋白质分离、蛋白质印迹、交变脉冲凝胶电泳及等电聚焦。
琼脂糖凝胶作为重要的电泳介质的特点：
（1）易于制备凝胶；
（2）其孔径较大，因此可用于免疫固定、免疫电泳和微量制备以及分离分子量比较大的物质；
（3）其机械强度较高；琼脂糖无毒；
（4）易于染色、脱色及储存电泳结果；
（5）琼脂糖的胶凝温度一般在３４～４３℃，融化温度在７５～９０℃。但是琼脂糖凝胶具有不同程度的电内渗，凝胶容易脱水收缩。

醋酸纤维薄膜
醋酸纤维是纤维素的醋酸酯，用醋酸纤维薄膜作支持介质的电泳操作简单、快速、价廉，目前多用于临床检验和医学上的常规分析。